Le spectateur peut contempler tout d’abord une vitrine consacrée aux origines de la science, grecque avec un manuscrit carolingien copié dans le monastère de Fulda contenant divers textes d’Hippocrate, un manuscrit universitaire du XIIIe siècle d’Aristote et un incunable précieux d’Avicenne. La vitrine suivante évoque la découverte du monde avec des gobelets témoins de l’« or des Incas », une édition latine du récit de Christophe Colomb, un portulan et l’édition originale du Robinson Crusoé de Daniel Defoe. La philosophie et les sciences sont présentées à travers les grandes révolutions : Francis Bacon, René Descartes, Charles Darwin et Sigmund Freud.
Puis les branches de la sciences moderne : l’astronomie et la remise en cause de la vision héliocentrique avec Claude Ptolémée, Nicolas Copernic, Johann Kepler et Galilée ainsi que les globes de Vincenzo Coronelli et une série de tapisseries représentant « Les planètes et leurs enfants » ; la physique avec Isaac Newton, Marie Curie et Albert Einstein ; les mathématiques avec Blaise Pascal et Leonhard Euler; la médecine enfin avec un manuscrit sur la balnéothérapie, une édition d’Ambroise Paré et un autographe de Louis Pasteur.